El Centro Interdisciplinario de Ciencias de la Salud, Unidad Santo tomas (CICS UST), es la institución educativa en el área medico biológicas del Instituto Politécnico Nacional (IPN), que forma profesionales y líderes con alto nivel competitivo en los campos de Odontología, Optometría y Psicología a nivel licenciatura y posgrado, con conocimientos, valores y principios; a fin de atender las demandas actuales y emergentes de prevención, diagnóstico y tratamiento en las áreas de la salud. Mediante actividades de aprendizaje, prácticas de investigación básica y aplicada de forma interdisciplinaria, fomentando la creatividad y la cultura emprendedora en nuestros estudiantes, así como la innovación para el desarrollo humanístico, sustentable, social, tecnológico y económico, a través de programas académicos pertinentes en la modalidad escolarizada, contribuyendo así al logro de los objetivos del IPN.
Ser una institución educativa de excelencia, de calidad, ampliamente reconocida y líder en la formación y profesionalización de futuros odontólogos, psicólogos y optometristas a nivel superior y posgrado. Reconocida por sus programas académicos con enfoque aplicado y práctico. Compromete sus acciones al servicio de la sociedad en el área de la salud, en un marco de diversidad e interculturalidad, equidad de género, transparencia, inclusión, sustentabilidad y responsabilidad social; ampliando oportunidades hacia la mejora continua, cumpliendo con las normas institucionales y definidas por instancias nacionales e internacionales.
En marzo de 2000 se creó el proyecto académico de la Escuela Superior de Ciencias de la Salud con características similares al CICS de Milpa Alta, que estaría ubicada en el casco de Santo Tomás, posteriormente en abril del mismo año, el Consejo General Consultivo del IPN acordó el cambio de la nominación de la escuela por el de Centro Interdisciplinario de Ciencias de la Salud Unidad Santo Tomás; este plantel utilizaba el mismo logotipo del CICS original, agregando en la parte inferior del mismo las siglas UST para diferenciarlo del CICS Unidad Milpa Alta. A partir del año 2000, la Carrera de Optometría, que había sido fundada en 1950 en la ESMR, salió de la Escuela Superior de Medicina para formar parte, entre otras carreras de las ciencias de la salud, del Centro Interdisciplinario de Ciencias de la Salud, Unidad Santo Tomás.
En la sesión del 24 de mayo del 2000 del HCGC del IPN se emite el acuerdo de aprobación de la estructura de los Planes de Estudio de las Carreras de Licenciado en Odontología y Licenciado en Psicología. En agosto del 2000 se inicia con algunos alumnos de las Generaciones 23° y 24° del Centro Interdisciplinario de Ciencias de la Salud Unidad Milpa Alta (CICS UMA) y la Primera Generación del CICS UST.
El Instituto Politécnico Nacional con su interminable tarea de cumplir con su objetivo de ofrecer alternativas al país para la formación de recursos humanos de excelencia que respondan a las necesidades de éste, se creó el Centro Interdisciplinario de Ciencias de la Salud Unidad Santo Tomás en julio del 2000, para impartir los programas académicos de las Licenciaturas de Odontología, Optometría, Psicología y las demás que apruebe el Consejo General Consultivo.
De acuerdo a esta conformación del Centro Interdisciplinario de Ciencias de la Salud Unidad Santo Tomás, actualmente se persigue el mejor aprovechamiento y uso de la planta académica, la infraestructura física y el fortalecimiento de los servicios que ofrece el Instituto en esta rama del conocimiento, así como la concentración de especialidades de la misma unidad académica, con el fin de mantener el compromiso establecido de cumplir permanentemente actualizados los programas académicos y los planes de estudio, y de esta manera continuar contribuyendo con eficacia y pertinencia con los sectores productivos del país, así como desarrollar proyectos de Investigación que fomenten innovaciones en las Ciencias de la Salud, y definir programas orientados a desarrollar una cultura de la salud, basada en el entorno físico y social.
Las siglas del nombre del centro CICS, armónicamente entrelazadas, en color guinda sobre fondo blanco, arriba del Logo las siguas IPN de Instituto Politécnico Nacional, en la parte inferior las siglas CICS-UST correspondientes a Centro Interdisciplinario de Ciencias de la Salud Unidad Santo Tomás.